De Vlaamse overheid wil dat alle vaccinatoren systematisch gebruik maken van Vaccinnet. Daarom kunnen gratis vaccins vanaf 1 januari 2014 nog alleen via Vaccinnet besteld worden.
De veralgemening van het gebruik van Vaccinnet is een van de doelstellingen van het Vlaams actieplan voor vaccinaties, dat vorig jaar werd opgesteld. Daarin wordt vooropgezet dat in 2015 Vaccinnet systematisch door alle vaccinatoren moet worden gebruikt. Die doelstelling wordt nu vervroegd door de gratis bestellingen binnenkort enkel nog via Vaccinnet te laten verlopen.